学校一贯重视科学研究工作。1956年独立建院后，在坚持以教学为主的前提下，积极创造条件开展科学研究。根据农业生产发展需要和学校在一些学科上的优势建立了研究室（所），对各课题的研究力量，也有计划地进行了调整。认真落实知识分子政策，正确处理研究工作中的矛盾和问题，充分调动中年教师的积极性。因而在科学研究上取得了较大的成绩。十年来着重抓了以下工作：

一、建立研究机构

1957年成立了四川农学院科学研究委员会，统一领导全校科研工作。

1964年2月，成立了四川农学院学术委员会，负责审议科学研究规划、计划，讨论科学研究工作中的重大问题，鉴定科研成果和指导出版学报等。委员会由12人组成。院长杨允奎教授任主任委员。

为了加强对科研工作的具体领导，1960年1月3日学校党委扩大会议决定成立科研处，由肖永祚任副处长。

为了集中力量，进行重点研究工作，建院后，就建立了“水稻研究室”、“小麦发育形态研究室”。1957年又建立了“山地农业研究室”。1960年3月9日省高教局《关于四川省高等学校1960年建立科研机构的通知》决定在四川农学院建立：野生生物研究所，遗传选种研究所，畜牧研究所，兽医研究所、同位素应用研究室、农业机械化研究室。在贯彻“高教六十条”时，考虑到学校的具体条件，对研究所室进行了调整。

1962年3月撤销农学系的遗传选种研究所，牧医系的畜牧、兽医两个研究所，生物系的野生生物研究所和农机系的农机研究室，其科研任务和资料移交有关教研组。保留同位素应用、稻作、小麦发育形态3个研究室以及邛崃地区复种轮作研究室基点。1963年，成立数量遗传试验室和猪饲养试验室。原设同位素应用，稻作、小麦发育形态研究室统一改为试验室。

1962年5月科研处教务处合并。

二、调整研究课题，突出重点

根据国家科学研究规划，两度调整了研究课题，尽量使全部研究项目与国家计划要求相适应。同时，结合原有科研工作基础，和技术力量加强了对作物和畜禽优良品种的选育研究。根据农业生产发展情况，在六十年代初期培育出适应当时生产条件的一批优良品种和杂交组合，经过生产鉴定，在省内外繁殖推广的，水稻试验室有川大粳稻、跃进二、三、四号四个品种，小麦试验室有雅安早，竹叶青、大头黄三个品种，数量遗传试验室有玉米双交一号、双交三号、双交五号、双交七号、矮三交、矮双苞等六个杂交组合。在畜禽方面繁殖推广的有巴南猪，成都白鸡，川农黄鸡(原名金甲)。均在生产中发挥了一定作用，受到群众的欢迎。

同位素应用试验室开展了对电离辐射对鸡孵化的影响以及母鸡甲状腺的吸碘能力测定以及r射线对油菜、水稻生长发育及产量影响试验等11项课题的研究。牧医系动物学教研组的鸟类研究，采集了相当数量的标本，以后陆续发现一些新亚种，为编写《中国动物志》的鸟类志提供了新资料。

三、深入农村，把校内控制性的试验研究同校外群众性的科学试验结合起来

1958年全校师生下放农村劳动锻炼，在雅安、内江、温江三地区建立农村基点，开展农牧业的生产调查和生产经验总结及丰产试验，以后又派出师生进行作物裁培、耕作制度、饲料资源以及家畜生产和主要疾病等的基本情况调查研究，为科研工作进一步联系实际提供了基础资料依据。1959年9月重新整顿农村基点，先后在邛崃东安公社、名山百丈公社、雅安多营公社、灯塔公社、城南公社建立科学试验基点。在乐山建立“棚鸭业调查研究”点、雅安蔡龙公社设立了家畜疾病防治点。据不完全统计，搞样板田约1500余亩，举办兽医、植病防治，玉米制种等训练班20多次，培训公社技术人员2200多人次。这些工作有效地支援了农业，也提高了教师的政治觉悟和业务能力并充实了科学研究的内容。在整风反右后，鉴于雅安地处盆周山区边缘，学校于1957年11月开展了山地农业研究，先后多次组织专业教师对二郎山区的植物资源，土壤状况和农牧业生产特点等进行了专题研究，积累了相当数量的标本和资料，出版“山地农业科学”刊物六期，发表了研究文章，受到有关业务部门的重视。

四、开展学术交流

1957年5月26日至6月1日，学校举行了科学报告会。参加人员除学校教师外，还有来自甘孜、康定、凉山、重庆、成都、西昌、内江、雅安等地的农林牧兽医工作者，农村工作干部，兄弟院校的教师和有关单位的代表170余人。宣读论文35篇。论文数为独立建院前两倍多。这次科学报告会是独立建院后举行的第一次大会，是在建院过程中排除困难积极努力的结果，对师资培养和以后科研工作的开展以及教学质量的进一步提高都有着重要的促进作用。

从1957年至1961年，陆续出版了《山地农业科学》、《科学研究报告》、《农业科学译丛》、《科学简报》四种刊物，共220万字，向全国各地作了交流。

水稻专家杨开渠教授的水稻专著：《水稻栽培》、《双季稻，粳稻、再生稻的性状研究》、《稻作论文选集》、《稻的一生》以及与其他专家合著的《中国水稻栽培学》出版发行。

五、开始招收研究生

由于我校科学研究工作有了较大的发展，于1959年开始招收研究生。先后有1959年院长杨开渠教授招收的水稻栽培专业研究生一名，1962年畜牧兽医系主任陈之长教授招收的兽医产科研究生一名，1964年杨允奎教授招收的玉米育种研究生二名、杨凤教授招收的家畜饲养研究生一名，邱洋聘教授招收的家禽育种研究生一名。

六、对外联系和交流

1956年11月，牧医系主任陈之长教授随高教部组织的赴苏访问团访问了苏联，共访问30所农业院校，12个研究机构和一些集体农庄，国营农场。回校后向全校师生作了访问报告。

5月，苏联白俄罗斯别洛露西亚农学院与我校建立校际联系。院长、农学博士，教授弗·加尔库沙于1957年5月给我校杨开渠院长来信，向我校师生致意，并著文介绍该院情况。

根据农业部的决定，在我国江苏句容农校学习的越南留学生5人(4男1女)，由句容农校教师带队，于1959年11月29日到我校实习。学习的课程为饲料分析、家畜繁育、家禽改良、乳牛改良等。为保证留学生的学习和生活，在牧医系党总支领导下成立两个小组，教学小组由畜牧专业八位教师组成，负责讲课和实习，实验；生活福利小组，由院长办公室，牧医系办公室、保卫科、伙食科和事务科各抽一位同志共五人组成，负责食宿，保卫和其他福利工作。1960年3月这些越南留学生顺利地完成了学习任务。